云南省植物学会
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"如果每位研究者,在使用一个物种学名时都能够附上参考文献,那么分类学一定会是影响因子最高的学科之一”,圈子里时常可以听到这样的牢骚。在自然科学的发生发展过程中,对事物性质的区分与对事物变化规律的研究,一直是相辅相成、难分伯仲的。这一点不管是在不同层次的自然对象研究之中,还是在脱离了具体研究实体的纯粹数学领域均是如此。因此对于物种的分类,特别是那些有赖于主观经验的分类,当前的挑战主要还是来自于量化研究的困难。尤其是进行多维度、大规模数据的信息提取和分析一直是相关领域协力而为的目标。其中,如何解决计算机在系统内和系统间发现、识别、访问、重用生物多样性数据,则是在宏观层面上与这一目标最为相关的基础课题。Natural Object Identifier · 自然索引(以下简称 NOI)就是针对这一问题的一次尝试。 1. NOI的理念是All Link Togather NOI 官方网站 https://noi.link 截止目前,通过各方合作,NOI 首期上线的资源,聚合了包括中国数字植物标本馆(CVH)、中国科学院昆明植物研究所标本馆(KUN)、生命观察(Biotracks)、国家重要野生种质资源库(GBOWS)、国家标本平台(NSII)等国内在线平台近 190 万条植物标本、物种观察记录和活体材料的信息索引。同时,基于各类知识共享协议,我们还收集包括英国皇家植物园标本馆(K)、英国爱丁堡植物园标本馆(E)、美国史密森自然历史博物馆(US)、巴黎自然历史博物馆(P)、密苏里植物园(MO)等境外机构收藏的40多万份中国植物标本的信息(含诸多模式)。 NOI 为这些资源总共分发了 229 万个 NOI 号,未来我们还将继续与各方密切合作,不断提高资源索引量。 2. NOI 是一个资源标识平台 类似于 DOI,NOI 中的每份资源,都会获得一个用于身份标识的资源标识符(比如 NOI:668517),每一个标识符都有一个持久的、全球唯一的 URL 链接(比如https://noi.link/NOI:668517),该链接将永久的指向该 NOI 指代的资源。同时,用户在 NOI 上查看资源时 NOI 还可以为每份资源生成一个规范的文献引文,比如下面这一份来自于 KUN 的 1208714 号标本的文献引文: 杨增宏, 95-1473. 1995-04-01. 中国, 云南省, 文山壮族苗族自治州, 麻栗坡县. 昆明: 中国科学院昆明植物研究所标本馆, 2020-12-04T14:39:40+08:00. https://noi.link/NOI:668517 不同于 DOI 的层级码,NOI 采用双码制。即一份资源可以有两个唯一编码。其中一个编码是 NOI 平台主动分配给对象的 NOI 码;另一个为资源发布者注册时提交的编码,该编码同样需要确保全球唯一性。对于植物标本馆,我们推荐使用“国际标本馆代码:内部唯一编号”组成,其中唯一编号建议尽可能使用已经条形码化的编号,以降低人工编排和转录出错的概率。对于资源的引用,两个编码是等效的,比如对于上个引文,下方引文是完全等同的: 杨增宏, 95-1473. 1995-04-01. 中国, 云南省, 文山壮族苗族自治州, 麻栗坡县. 昆明: 中国科学院昆明植物研究所标本馆, 2020-12-04T14:39:40+08:00. https://noi.link/KUN:1208714 两个引文中, 第一个引文的 NOI 号是由 NOI 分发,不可改写,因此可以保证绝对稳定;第二个引文中的机构资源编码,则是由机构分配,错误时可以改写,因此只能保证相对稳定。任何时候,双码一一对应,都可以指向同一对象。因此前者更适合作为长期引用使用,后者更适合机构内部使用(如果对内部编码体系有足够的信心,也可以直接将其作为稳定的链接推荐给外部人员使用)。 除此之外,双码制还可以很好的兼顾异步分码的需求,在资源未被真实注册时,可以利用内部码先生成引用链接(比如 https://noi.link/KUN:1208714),在完成 NOI 注册之后这些链接即可被激活使用,而同一资源通过不同平台注册NOI,内部码的存在也可以保证不同资源提交的索引都可以指向同一个NOI。 3. NOI 是一个引文生成平台 NOI 不仅可以生成引文,还可以将多个引文打包为 BibTex 文件,该文件可以被导入到常用的文献管理软件中,从而可以像管理文献一样管理标本资源。
导入 Papers 文献管理软件中的标本索引,你可以像普通文献一样将其插入到自己撰写的论文之中 除此之外,NOI 同样支持将多条记录合并为单个合集。合集会有自己的访问页面、标识符和文献引文。不同于单条记录的标识符前缀为 NOI, 在 NOI 中合集和数据集的标识符前缀为 NOISET,而合集的文献引文内容则会根据合集创建者的身份信息自动生成。 这里演示了将多份杜鹃花属模式标本合并为一个合集,该合集具有唯一的 NOISET 标识符和访问链接,同时还会生成规范的文献引文: 徐洲锋. Type Of Rhododendron. 中国科学院昆明植物研究所. 2021-01-17T23:36:25+08:00.https://noi.link/NOISET:1 4. NOI 是一个 1+1 > 2 的平台 在 NOI 上设立专题,其实是相互增益的,这主要体现在: (1)对于尚无在线平台以承载自身数据的组织或团体,可以借助 NOI 宣传自己,并对外提供数据服务。 (2)对于中小型数据平台,资源的直接访问量通常是比较有限的。借助 NOI 将其与其他平台的索引汇集在一起,信息的规模和维度都会互相得到加强,相应平台的访问流量和服务价值必然会同步得到提升。 (3)实现索引而非数据的聚合,也为国内未来生物多样性数据的真正汇集创造了一个良好的缓冲,并将促使领域更多的关注学科更深层次的需求,因此从长远来看会有利于国内生物多样性信息学平台的发展,也是对目前各类国字号平台的有益补充 5. NOI 是一个注重个人价值的平台 6. NOI 是谁资助的 |
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